本发明公开了一种益生菌制备方法，属于益生菌制备领域，本方案可以实现对厌氧性的益生菌颗粒进行干燥处理时，将益生菌颗粒放置在固定框架表面，此时的益生菌颗粒表面附着的培养液逐渐流落在明胶薄膜表面，使得明胶薄膜逐渐融化，明胶薄膜内的还原性铁粉球与空气中的氧气发生反应，形成四氧化三铁，产生热量，同时进行除氧反应，减小厌氧性益生菌的死亡数量，而第一电磁铁和第二电磁铁通过磁性吸引带动着连接线进行上下移动，使得外弹性球框对烘干箱内的益生菌颗粒进行搅散，提高益生菌颗粒烘干的效率，同时也加速对烘干箱内的氧气耗氧效率，且口径较小的益生菌颗粒从筛分套筒内流落至固定框架的下侧，对益生菌颗粒进行筛分。