本实用新型公开了一种海区进水口大型杂藻处理装置，包括由支撑架和固定在支撑架上的过滤网围成的箱体，所述箱体的一个侧面设置有用于连接水泵进水端的进水孔；还包括连接在所述箱体上并用于连接水泵出水端的高压侧分出水管，所述高压侧分出水管上设置有高压冲刷喷头。通过支撑架和过滤网扩大了进水管周围洁净水体体积，高压冲刷喷头对过滤网侧面高压冲刷解决了杂藻附着引起的进水系统低压对支撑架、过滤网等的损坏，延长了育苗进水系统相关设备的使用寿命；大大减少了进入养殖水系统的杂藻数量，降低了杂藻腐烂对养殖水质的影响，延长了水系统清理周期，降低了劳动强度和生产成本。