本发明公开一种三文鱼内脏鱼油的制备方法，包括原料预处理、一段酶解、二段酶解；所述的一段酶解主要为脂肪酶酶解，同时辅助增强自溶酶酶解进程，该过程中添加氯化钙；所述的二段酶解为蛋白酶酶解。本发明方法可显著缩短鱼油提取时间，明显提高鱼油提取率，同时制备的内脏粗鱼油色泽橙黄明亮清透、基本无腥味无异味，品质得到显著改善，有效降低鱼油提取过程中的酸败程度，提高了内脏鱼油的可接受度同时扩大了其应用途径，改善了其加工适用性。