本发明公开了一种高产乙酸乙酯费比恩毕赤酵母及其在清香型小曲白酒生产中的应用。所述费比恩毕赤酵母菌株为费比恩毕赤酵母（Pichia fabianii）Y10菌株，保藏于中国典型培养物保藏中心（CCTCC），保藏日期为2022年4月29日，保藏编号为CCTCC NO:M2022527。本发明的高产酯费比恩毕赤酵母具有良好的温度、高糖、低酸和酒精耐受性，能够适应清香型小曲白酒发酵酿造环境要求。将该酵母制备的酒曲与桂花曲配成混合曲应用于清香型小曲原酒酿造中，生产出的酒体中乙酸乙酯含量达1.07g/L，比生产对照组提升了55％。