本发明公开了一种提高配制酒中红曲色素稳定性的方法及色素保护剂，包括以下步骤：1）取配方量的乙二胺四乙酸、中药材提取物、含游离氨基的食品配料、α‑环糊精和/或γ‑环糊精混合均匀，制得色素保护剂；2）称取固体红曲米、红曲色素或红曲粉，加入步色素保护剂，加酸度调节剂，浸提后冷却至室温，过滤得红曲色素浸出液；3）加红曲色素浸出液于配制酒中直至配制酒色价为0.2‑3.0，同时加酸度调节剂至配制酒的pH介于5.5‑7.5之间，则为成品。本发明中红曲色素与配制酒分开浸提，从生产开始阶段保护红曲色素；色素保护剂中包括含游离氨基的食品组分，游离氨基可以与红曲色素中易发生降解的基团结合，对红曲色素提供进一步保护。