本发明公开了混合信号去工频干扰方法及系统，涉及信号处理技术领域，其方法包括：生成混合信号X的分离矩阵W，分析W第i行向量Wi的目标函数；获取粒子群参数，进行粒子群迭代；若满足迭代终止条件，则输出种群最优位置作为目标函数的解，计算得到Wi的值；计算X中某一独立源信号的近似信号，消除近似信号得到新的混合信号；第m次分离一独立源信号的近似信号之后，生成新的分离矩阵，分析新的目标函数，根据粒子群算法计算新的分离矩阵的第i行向量，从新的混合信号中再次分离又一独立源信号的近似信号，直至混合信号中的工频信号消除。本发明基于改进粒子群优化独立分量分析的去工频干扰方法，简化了粒子搜索流程，提高了迭代速度，起到了抑制噪声的作用。