本发明属于甘油二酯油技术领域，具体公开了一种风味甘油二酯油的制备方法，包括如下步骤：将毛油、酶制剂、螯合剂混合，调节含水量，高速剪切，放入摇床中保温，过滤，得到脱胶液；向脱胶液中加入甘油、脂肪酶，放入真空反应器中反应，反应的同时采用气体吸附剂收集反应气体，离心取油层，得到反应产物；将反应产物分子蒸馏，得到重相为甘油二酯、甘油三酯的混合物，分提，得到甘油二酯油，将收集的反应气体通入至甘油二酯油中解析，得到风味甘油二酯油。本发明酶法脱胶的水分含量＜0.2%，同时不会造成香味物质流失，油脂的风味物质保留率达到90%以上。