本发明公开了一种多处理器异构系统的看门狗控制系统及其控制方法，包括多处理器模块，其特征在于，包括看门狗控制模块和看门狗芯片模块，所述看门狗控制模块分别与处理器模块和看门狗芯片模块电连接。优点：本发明能够使同样的处理器系统复位时间从60秒缩短为5秒，大大减少复位时间，能够发生程序跑飞时保证处理器的实时性；本发明能够让所有处理器同时复位，而不是某个处理器单独复位，而其他处理器正常工作，这样不会导致复位的处理器与正常工作的处理器由于数据交互异常导致的设备工作异常，使设备误发信号，错误动作；本发明提高了SOC资源使用率，减少设备成本。