本发明公开了一种二次舱顶盖导流槽式防水结构，包括导流槽，导流槽包括管道和截面，截面设有底边、腹边和翼边；底边和腹边形成开口且底边、腹边和翼边成几字形；导流槽倒置开口向上，导流槽的管道沿人字梁的斜边平行方向延伸且焊接在人字梁的斜边上；顶盖板拼装好焊接在导流槽的翼边上，所述顶盖板向下折边形成下层台阶面，在下层台阶面设置有若干长腰孔。本发明让汇入导流槽的雨水通过下层台阶面上的长腰孔排出；在焊缝泄漏时，雨水不会因吸虹作用沿顶盖板内表面进入舱体内，而是沿折边下沿滴入导流槽内；本发明顶盖板下沿折双层台阶为舱体提供了二次防水，提高了防护等级，保证了舱内设备安全。