本发明提供一种精炼糖离子交换脱色节水工艺，包括如下步骤：S1、脱糖：糖液完成脱色过程后，用温水将离子交换柱内的糖浆置换到进料箱内以完成脱糖，然后利用上一周期快速反洗离子交换柱排空时所排出的回收水进行慢、快反洗离子交换柱，所产生的快慢反洗水回收到甜水箱；S2、再生：将离子交换柱内树脂吸附的色素进行置换，先利用上一周期产生的低浓度低盐废水进行盐置换，该部分高盐高浓度废水收集到废卤水罐中，然后再利用冲洗水进行冲洗，将该部分低浓度低盐废水进行回收，用于下一个周期中盐置换初步冲洗；S3、卤水处理：将废卤水罐内高盐高浓度废水先进行纳滤处理。本发明有助于节约水资源、增加糖份的回收、减少污水的排放。