本发明属于食用油加工技术领域，涉及一种用于控制食用油中3‑MCPD酯和缩水甘油酯生成的加工工艺，包括如下步骤：（1）将毛油过滤后加入混合助剂，常温下搅拌混合并超声，离心分离得到油相；（2）向步骤（1）得到的油相中加入混合助剂，常温下搅拌混合并超声，离心分离得到油相；重复进行6次操作；（3）向步骤（2）离心后得到的油相食用油中加入硅胶脱胶，离心分离后得到油相，重复两次，将得到的油相过滤，经过脱色，再次过滤后，对食用油进行低温脱臭，再进入脱酸装置中低温快速脱酸，即得成品油。该工艺能够在前期将塑化剂脱除，后期不需要设置高温蒸馏的步骤，从而避免了高温导致的缩水甘油酯和3‑MCPD酯的形成。