本实用新型公开了一种屋面变形缝防水结构，该屋面变形缝防水结构包括：屋面板，所述屋面板上设置有变形缝；第一立板和第二立板，所述第一立板和所述第二立板均设置在所述屋面板上且沿竖直方向延伸，所述变形缝位于所述第一立板和所述第二立板之间；盖板，所述盖板设置在所述第一立板的顶部，且所述盖板与所述第二立板的顶面之间形成有与所述变形缝连通的侧缝；密封防水物，所述密封防水物填充在所述侧缝内，以用于实现所述侧缝处的密封防水。本实用新型有效解决了相关技术中橡胶止水带更换困难，操作难度大的问题。