本发明公开了一种处理搜索系统Java实例垃圾回收的方法，其特征在于，通过按照管理员配置的特定策略进行统一的垃圾回收策略的调配，用以减少因为搜索系统Java实例垃圾回收导致的全局暂停的时间，包括在搜索系统中划分出不止一个的服务集群，每个集群都配置对外服务的开关状态；配置搜索系统的主动GC监控线程；将主动GC调度的目标集群中的所有Java实例按照当前CPU和内存的使用运行状态进行队列排序；采用串行和并行方式调用队列中的System.gc（）主动申请GC等。达到避免单个实例GC导致的其余关联节点服务不可控，无需后期太多人力干扰，缩短无效的预热等待时间，全自动执行，无需人工干预，节约了运维人力成本，使得搜索系统具有一定的自动维护特性的效果。