本发明提供了小麦胚芽复合油的提取方法，包括原料粉碎‑微波处理‑复合酶解提油‑破乳化‑油清洗‑脱色‑脱臭等7个步骤；本发明首先采用高温瞬间爆破的方法对小麦胚芽和芝麻进行爆破，可以充分灭活小麦胚芽和芝麻中的各种酶，并且避免了高温灭酶对营养成分的损害，为后续的提取工艺创造了条件；本发明中的微波处理过程可以使粉碎的小麦胚芽和芝麻一部分的细胞壁破裂、膨胀，从而使部分脂肪处于游离状态，可以有效提高复合油的提取效率；另外，本发明结合酶提取‑去乳化的工艺，有效减小了油的损失，提高了油的提取率；再者，本发明采用盐洗‑水洗的工艺，能够洗去油中的杂质，使得获得的油品纯度高，色泽好，质量优异。