本发明提供了一种提取小麦胚芽复合油的方法，包括原料粉碎‑微波处理‑复合酶解提油‑破乳化‑油清洗‑脱色‑脱臭等7个步骤；本发明首先采用高温瞬间爆破的方法对小麦胚芽、芝麻和花生仁进行爆破，可以充分灭活原料中的各种酶，并且避免了高温灭酶对营养成分的损害，为后续的提取工艺创造了条件；本发明中的微波处理过程可以使粉碎的小麦胚芽和芝麻、花生仁一部分的细胞壁破裂、膨胀，从而使部分脂肪处于游离状态，可以有效提高复合油的提取效率；另外，本发明结合酶提取‑去乳化的工艺，有效减小了油的损失，提高了油的提取率；再者，本发明采用盐洗‑水洗的工艺，能够洗去油中的杂质，使得获得的油品纯度高，色泽好，质量优异。