本发明属于面条制备技术领域，涉及多层杂粮面条的制备方法、多层杂粮面条和应用。该制备方法包括：分别制备外层面带、杂粮层面带和粘合层面带，将外层面带、杂粮层面带和粘合层面带进行复合，进行延压和切条，得到多层杂粮面条；其中，外层面带的制备包括将预处理面粉与未处理面粉混合得到混合粉，向混合粉中加入助剂，然后通过分步加水的方式进行和面，经醒面和延压后得到外层面带；杂粮层面带的制备包括将粒度分布D50为40－100μm的面粉与粒度分布D50为20－120μm的杂粮粉混合，经和面和延压后得到杂粮层面带。本发明能克服杂粮粉不易与面团结合、容易出现分层的问题，减少盐、碱添加物的使用量，增加杂粮粉的添加量。