本发明涉及一种有色抗老化双向拉伸聚酯薄膜及其制备方法，所述有色抗老化双向拉伸聚酯薄膜为三层复合结构，其特征在于，中间层为有色层，有色层原料包括光学聚酯切片，色母粒，紫外阻隔母粒，分散剂，所述分散剂包括硬脂酸酯和磺化改性聚乙烯醇；有色层的两侧为透明抗紫外层，透明抗紫外层的原料包括光学聚酯切片，紫外吸收剂。本发明的有色抗老化双向拉伸聚酯薄膜颜色均匀，并且颜色的稳定性好，在有机溶剂浸渍，或者在湿热老化条件下放置，也不会产生色斑、色晕、褪色等现象。