本实用新型公开了一种松花肽制备及纯化工艺系统，包括：进粉组件，连接于进粉组件的气流破壁机，连接于气流破壁机的超临界脱脂设备，接于超临界脱脂设备后的酶解罐，酶解罐分别与酸碱罐、配制罐相连，连接于酶解罐后的超滤循环组件，连接于超滤循环组件的第一纳滤系统，连接于第一纳滤系统的第二纳滤系统，连接于超滤循环组件和第一纳滤系统的喷雾干燥系统，连接于第二纳滤系统的冷冻干燥系统；本实用新型能够在获得不同分子量的松花肽基础上，得到松花粉超临界提取物和松花粉水提物，使得松花粉获得更加全面应用。