本实用新型提供一种山核桃自动剥壳加工系统，包括：煮具，用于煮制待处理的山核桃干籽，以得到第一预制品；存储器具，用于静置存储第一预制品，以使得第一预制品复水得到第二预制品；破壳单元，用于对第二预制品进行破壳加工，以得到第三预制品；筛分单元，用于筛除第三预制品中的碎仁、果壳，以得到第四预制品；色选装置，用于选除第四预制品中的果壳、坏果仁、杂质、以及果壳和果仁未完全分离的颗粒；多个传输装置，用于传送山核桃籽，破壳单元、筛分单元、色选装置之间依次通过传输装置连接。通过本申请提供的山核桃自动剥壳加工系统实现山核桃的自动化剥壳，大幅度的提高剥壳效率以及降低碎仁率，提高成品品质。