本实用新型涉及分析仪器技术领域，具体地涉及到一种离子阱质谱仪，包括：多个散热装置，对应于设置于离子阱质谱仪内部的多个区域，用于对多个区域分别进行散热；多个温度测量装置，分别设置于多个区域，用于测量多个区域的温度；电路板，电路板分别与多个散热装置以及多个温度测量装置电性连接。本实用新型中的离子阱质谱仪通过对离子阱质谱仪内部的多个区域分别进行独立的温度测量和精准的温度控制，确保离子阱质谱仪内部各个区域都能够保持合理的温度，同时避免散热装置无效工作，减少非必要的功耗和噪音的产生。