本发明公开了沉箱安全注排水系统及注排水工艺，所述沉箱安全注排水系统，包括设于沉箱外部的外设机构和可拆卸的安装于沉箱上的预设机构；所述外设机构包括浮体，第一潜水泵和安装在浮体上的供电单元，所述第一潜水泵泵体悬吊在浮体上，其注水管接头设于浮体上，第一潜水泵电连接供电单元；预设机构包括注水水带和第二潜水泵，注水水带的出水口设于舱格内，进水口悬挂在沉箱外部，注水水带的进水口与第一注水管接头连接，第二潜水泵泵体设于舱格内，其出水管排水口和供电电缆设于沉箱外部，其供电电缆的电源接头可电连接供电单元。该系统和工艺可经济高效的完成沉箱注排水操作，并可实现注排水过程中沉箱顶部无人作业，提高施工安全性。