本发明公开了一种猪繁殖与呼吸综合症病毒‑猪流感病毒重构病毒体疫苗及其制备方法和用途。所述疫苗含有猪繁殖与呼吸综合症病毒‑猪流感病毒重构病毒体抗原和稳定佐剂复合物，所述猪繁殖与呼吸综合症病毒‑猪流感病毒重构病毒体是由猪繁殖与呼吸综合症病毒通过直接吸附或共价结合在猪流感病毒重构病毒体表面形成，其中，所述猪流感病毒重构病毒体是含有磷脂双分子层的微小囊泡，在磷脂双分子层表面结合有猪流感病毒血凝素和神经氨酸酶蛋白。本发明制备得到的疫苗具有安全、高效、使用方便、效期长等特点。通过滴鼻免疫即可达到降低及/或清除呼吸综合征病毒及/或猪流感病毒目的。