学院拥有工商管理、管理科学与工程、图书档案学三个一级学科中的十一个本科专业：工商管理、会计学、国际会计、旅游管理、市场营销学、财务管理、人力资源管理、信息管理与信息系统、电子商务、图书馆学、档案学；十三个硕士学位授权学科（专业）：企业管理、会计学、旅游管理、人力资源管理、管理科学与工程、技术经济与管理、图书馆学、情报学、档案学、MBA（包括EMBA）、MPACC(会计硕士)、MPM（项目管理硕士）、MEM（工程管理硕士）、MLIS（图书情报硕士）、MV（资产评估硕士）、公司治理；拥有工商管理一级学科博士学位授权点（包括企业管理、会计学、技术经济与管理、公司治理、人力资源管理）和管理科学与工程、图书馆学、情报学八个博士学位授权点。

2005年学院复名为南开大学商学院。目前全院教职工200人。专职教师122人，其中教授48人（博士生导师47人）、副教授51人、副研究员2人、讲师20人、工程师1人。

学院的本科生、研究生在校人数达到四千八百多人。在南开大学图书馆300余万册图书的基础上，学院图书资料中心共有中外文图书15万余册，期刊700多种。有35个多媒体教室、11个专业实验室，近5千平米。

经历八十六年的风雨沧桑，沐浴二十五年的改革开放春风，南开大学商学院在改革中求发展，开拓创新，艰苦奋斗，团结拼搏，在学科建设、人才培养和服务经济主战场的高速路上驶入快车道，成为一个学科优势突出，专业设置合理，师资力量雄厚，管理运作良好，综合实力居于全国前列的商学院。是南开大学有活力、具发展潜力的学院之一。